熒光定量PCR儀是由熒光定量系統(tǒng)和計算機組成，用來監(jiān)測循環(huán)過程的熒光的產(chǎn)品，與實時設(shè)備相連的計算機收集熒光數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)通過開發(fā)的實時分析軟件以圖表的形式顯示。原始數(shù)據(jù)被繪制成熒光強度相對于循環(huán)數(shù)的圖表。
原始數(shù)據(jù)收集后可以開始分析。實時設(shè)備的軟件能使收集到的數(shù)據(jù)進行正?；幚韥韽浹a背景熒光的差異。正常化后可以設(shè)定域值水平，這就是分析熒光數(shù)據(jù)的水平。
為保證熒光定量PCR儀的有效運行、控制系統(tǒng)誤差、減少偶然誤差，使結(jié)果準確、可靠，使用過程中請檢驗實驗室工作人員仔細閱讀。
儀器的保養(yǎng)及維護：
1、儀器表面清潔，儀器的表面應(yīng)定期用軟布加少量清水擦洗，清洗后將儀器擦干。若有試劑泄漏在儀器表面，應(yīng)用軟布加70%酒精擦拭干凈。
2、反應(yīng)孔清潔，反應(yīng)孔沾染灰塵或雜質(zhì)后，會影響PCR擴增和熒光檢測，因此要定期清潔，一般3個月一次，可用吹氣球輕輕吹拭。為了防止灰塵進入反應(yīng)孔，儀器不使用時，必須關(guān)閉滑蓋。
清潔熒光定量PCR儀前必須關(guān)閉電源，并拔掉電源線。不要將液體傾倒在反應(yīng)模塊中或者儀器內(nèi)部。不能用強腐蝕性溶劑或者有機溶劑擦洗儀器。
3、保護儀器
不要頻繁開關(guān)儀器，兩次開關(guān)間隔時間不得低于30秒。實驗結(jié)束后不要立即關(guān)閉電源，保持待機狀態(tài)10分鐘后（此時儀器內(nèi)部風(fēng)扇仍在持續(xù)工作），待模塊溫度降至室溫再關(guān)閉電源。
4、過熱保護
熒光定量PCR儀的加熱系統(tǒng)設(shè)有過熱保護裝置，當加熱系統(tǒng)發(fā)生故障，溫度值超過允許范圍的上*，保護裝置會自動斷開，并不可恢復(fù)；此時，加熱系統(tǒng)無法繼續(xù)正常升降溫。
